تتولى وحدة الجمعيات العلمية الإشراف الإداري والتنظيمي على الجمعيات العلمية التابعة للجامعة، وفقًا للائحة الصادرة عن وزارة التعليم. وتشمل مهامها متابعة إجراءات التأسيس، واعتماد اللوائح الداخلية، والإشراف على انتخابات مجالس الإدارات، ومراجعة الخطط والبرامج السنوية، والتقارير المالية والإدارية. كما تنسّق الوحدة مع الجهات ذات العلاقة داخل الجامعة وخارجها، وتتابع توثيق الأنشطة ورفع التقارير الدورية، بما يضمن التزام الجمعيات بالأنظمة ويعزز دورها في خدمة التخصصات العلمية وتفعيل مساهمتها في المجتمع والبحث العلمي.